Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCQ7

Serpina1f, Alpha-1-antitrypsin 1-6, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1fQ9DCQ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Serpina1fQ9DCQ7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Serpina1fQ9DCQ7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Serpina1fQ9DCQ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms