Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xab2Q9DCD2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xab2Q9DCD2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms