Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc46a3Q9DC26 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc46a3Q9DC26 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms