Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rsph3bQ9DA80 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsph3bQ9DA80 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsph3bQ9DA80 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms