Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Subh2bvQ9D9Z7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms