Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D8L0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8L0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8L0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8L0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8L0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8L0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8L0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8L0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8L0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D8L0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D8L0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms