Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh4Q9D8F1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh4Q9D8F1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms