Protein–RNA interactions for Protein: Q9D809

2200002D01Rik, MCG22941, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2200002D01RikQ9D809 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
2200002D01RikQ9D809 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
2200002D01RikQ9D809 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
2200002D01RikQ9D809 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms