Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med8Q9D7W5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med8Q9D7W5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med8Q9D7W5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms