Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ap5s1Q9D742 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap5s1Q9D742 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap5s1Q9D742 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms