Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Speer4f1Q9D5Q6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Speer4f1Q9D5Q6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms