Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931423N10RikQ9D4J9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms