Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spns3Q9D232 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spns3Q9D232 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms