Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D1F3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D1F3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D1F3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D1F3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D1F3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D1F3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D1F3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D1F3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D1F3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D1F3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D1F3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D1F3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D1F3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D1F3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D1F3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D1F3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D1F3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q9D1F3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D1F3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q9D1F3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D1F3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D1F3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D1F3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D1F3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D1F3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D1F3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D1F3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D1F3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D1F3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D1F3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D1F3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q9D1F3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D1F3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q9D1F3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D1F3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D1F3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D1F3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q9D1F3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D1F3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q9D1F3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q9D1F3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9D1F3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D1F3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D1F3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D1F3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D1F3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D1F3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D1F3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D1F3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D1F3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms