Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa9Q9CZN4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa9Q9CZN4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa9Q9CZN4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms