Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mis18aQ9CZJ6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mis18aQ9CZJ6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mis18aQ9CZJ6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms