Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Lrrc17Q9CXD9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc17Q9CXD9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Lrrc17Q9CXD9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc17Q9CXD9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Lrrc17Q9CXD9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Lrrc17Q9CXD9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Lrrc17Q9CXD9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Lrrc17Q9CXD9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Lrrc17Q9CXD9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc17Q9CXD9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Lrrc17Q9CXD9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc17Q9CXD9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Lrrc17Q9CXD9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Lrrc17Q9CXD9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc17Q9CXD9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc17Q9CXD9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Lrrc17Q9CXD9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc17Q9CXD9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc17Q9CXD9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Lrrc17Q9CXD9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Lrrc17Q9CXD9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc17Q9CXD9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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