Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp23Q9CX11 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Utp23Q9CX11 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms