Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkrip1Q9CWV6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkrip1Q9CWV6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkrip1Q9CWV6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms