Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ddx28Q9CWT6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddx28Q9CWT6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddx28Q9CWT6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms