Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ly6kQ9CWP4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly6kQ9CWP4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms