Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sft2d3Q9CSV6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sft2d3Q9CSV6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sft2d3Q9CSV6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms