Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk5rap3Q99LM2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cdk5rap3Q99LM2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms