Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Abcf2Q99LE6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcf2Q99LE6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms