Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ciao1Q99KN2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ciao1Q99KN2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ciao1Q99KN2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms