Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Reep3Q99KK1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Reep3Q99KK1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Reep3Q99KK1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms