Protein–RNA interactions for Protein: Q99JF8

Psip1, PC4 and SFRS1-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psip1Q99JF8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psip1Q99JF8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psip1Q99JF8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Psip1Q99JF8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms