Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnf144aQ925F3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf144aQ925F3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf144aQ925F3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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