Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spdl1Q923A2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spdl1Q923A2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 322.2 ms