Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prpf3Q922U1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prpf3Q922U1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpf3Q922U1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms