Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cts3Q91ZD5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cts3Q91ZD5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cts3Q91ZD5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms