Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha7Q91Y13 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcdha7Q91Y13 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdha7Q91Y13 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms