Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rrp9Q91WM3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rrp9Q91WM3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp9Q91WM3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms