Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot6lQ8VEG6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnot6lQ8VEG6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnot6lQ8VEG6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cnot6lQ8VEG6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cnot6lQ8VEG6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6lQ8VEG6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6lQ8VEG6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6lQ8VEG6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6lQ8VEG6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6lQ8VEG6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6lQ8VEG6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6lQ8VEG6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6lQ8VEG6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnot6lQ8VEG6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms