Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smg8Q8VE18 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smg8Q8VE18 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg8Q8VE18 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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