Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CipcQ8R0W1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CipcQ8R0W1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CipcQ8R0W1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms