Protein–RNA interactions for Protein: Q8K205

Pop1, Processing of 1, ribonuclease P/MRP family, (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,045 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop1Q8K205 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pop1Q8K205 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pop1Q8K205 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pop1Q8K205 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pop1Q8K205 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms