Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh2d5Q8JZW5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh2d5Q8JZW5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sh2d5Q8JZW5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms