Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc4a8Q8JZR6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a8Q8JZR6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a8Q8JZR6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms