Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ClasrpQ8CFC7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ClasrpQ8CFC7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClasrpQ8CFC7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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