Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc28bQ8CEG5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc28bQ8CEG5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms