Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Lrrc9Q8CDN9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Lrrc9Q8CDN9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lrrc9Q8CDN9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.9 ms