Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E4f1Q8CCE9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
E4f1Q8CCE9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
E4f1Q8CCE9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms