Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV1

Trmt2a, tRNA (uracil-5-)-methyltransferase homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt2aQ8BNV1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trmt2aQ8BNV1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trmt2aQ8BNV1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trmt2aQ8BNV1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms