Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem260Q8BMD6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem260Q8BMD6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem260Q8BMD6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms