Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp4f39Q8BGU0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp4f39Q8BGU0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms