Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG51

Rhot1, Mitochondrial Rho GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhot1Q8BG51 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhot1Q8BG51 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhot1Q8BG51 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhot1Q8BG51 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms