Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M10.6Q85ZW5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-M10.6Q85ZW5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms