Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc155Q80VJ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc155Q80VJ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc155Q80VJ8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms