Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf139Q7TMV1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rnf139Q7TMV1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf139Q7TMV1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms